- 外显子测序常见问题
- Q1：外显子捕获测序的效率如何？A1：平均测序深度大于30X时，外显子组覆盖度达到杂交芯片可捕获的不低于90%的目标区域，发现杂交芯片可捕获区域中99%的SNPs(单核苷酸多态性)。 威九国际建议外显子组测序的测序深度为大于50X以上，对于肿瘤或者应用于临床上的研究，威九国际建议高深度测序。Q2：外显子测序在研究性染色体上的基……[阅读全文+]
- 简化基因组测序常见问题
- Q1：老师想用指定的酶进行RAD测序，可以吗？A1：采用现有流程未提供的酶涉及到购买酶、设计接头等，项目执行时间会有相应的延长。Q2：RAD-seq中，临时作图群体和永久作图群体分别是什么概念？A2：临时作图群体是双亲杂交以后自交或回交产生的F2或BC群体等，在子代个体中等位基因并不是完全纯和的，存在杂合，如果再自交，……[阅读全文+]
- 16S/18S/ITS扩增子测序常见问题
- Q1：16S产品有样品数量的要求，需要所有样品准备好了才能进行测序分析吗？A1：从科学的角度来讲，最好能够整批样品同时测序分析，既可以减少不同批次间的系统误差，还能节省项目周期。若样品准备有困难，也可以分批次启动，但需与客户说明由此可能带来的系统误差问题。Q2：若关注环境中的真核微生物多样性，ITS测序和18S测序哪个……[阅读全文+]
- 宏基因组测序常见问题
- Q1：土壤样品制备有哪些注意事项？A1：采样时，去除表面浮土，使用乙醇火烧的铲子挖取地下5至20厘米的土层，去除可见根后，土壤过2毫米筛网，每个样品从3个采样点采集并混合而成，其中样品量为50g，将采集的土壤样品保存于无菌离心管中，置于0℃以下，待样品采集完毕后，运回实验室，用于抽提DNA，如不能马上实验，请将土壤样品……[阅读全文+]
- 宏转录组测序常见问题
- Q1: 宏转录组测序取样有哪些注意事项？A1: 一定要注意避免RNA酶的污染，取样的所需耗材和器具等都需要RNAase-free处理，样品液氮速冻，干冰寄送，避免反复冻融。Q2：宏转录组测序可以提供哪些分析内容？A2：1. 去除低质量Reads 和Adaptors。2. 组装结果统计分析（多个样本默认分别组装，合并后聚……[阅读全文+]
- 全基因组甲基化测序常见问题
- Q1：Bisulfite-Seq 在项目开始之前需要考虑哪些因素？A1：是否为低甲基化率的物种；该物种的基因组完成情况如何（影响BS-SEQ的比对）；基因组是否存在复杂因素，如GC含量偏高、杂合度偏高、转座子、重复区域等。Q2：Bisulfite-Seq 有什么特殊接头？A2：Bisulfite 的甲基化接头中的所有C……[阅读全文+]
- ChIP-Seq常见问题
- Q1：哪些因素会影响ChIP-Seq的结果？A1：抗体的质量与特异性、需要富集的目标区域在基因组上的比例、ChIP的实验操作、DNA片段长度范围等都会影响ChIP-Seq的结果。Q2：哪些物种可以做ChIP-Seq？A2：物种为2倍体，基因拼接至染色体水平（NCBI），注释完整（GTF文件）即可。[阅读全文+]
- 目标区域甲基化常见问题
- Q1：目标区域捕获甲基化在项目开始之前需要考虑哪些因素？A1：首先要考虑选用哪种捕获kit，威九国际拥有三种成品捕获kit（BGI Promotor CaptureKit/Nimblegen SeaCap CpGiant/Agilent SureSelect Human Methyl-seq）以及完全定制化的捕获kit，可……[阅读全文+]
- 蛋白鉴定分析常见问题
- Q1：做蛋白质组全谱分析对是否要求物种有已知数据？A1：如果物种有已知的蛋白质组数据库，或有参考基因组、EST（或转录组）数据序列，做蛋白质全谱分析。对以上条件均不满足的物种，可在进行蛋白质组全谱分析的同时，做一个基因组或转录组测序，以便为蛋白质组全谱分析提供支持。Q2：蛋白质全谱分析两种技术有何优缺点？A2：1）SD……[阅读全文+]
- 蛋白定量分析常见问题
- Q1：应如何选择使用iTRAQ定量或Label-free定量？A1：若同组比较的样本数≤8，建议选择iTRAQ标记技术；若同组比较的样本数＞8，建议选择Label-free；若希望蛋白鉴定数越多越好，少量样品也可使用Label-free。Q2：样品重复、技术重复和上机重复有什么区别？A2：样品重复也可称生物重复。生物重……[阅读全文+]
- 蛋白修饰分析常见问题
- Q1：做磷酸化蛋白分析需要多少样品量？A1：对于单个蛋白质磷酸化鉴定需要一定纯度的微克级样品；对于磷酸化蛋白全谱鉴定则需要毫克级的样品。Q2：磷酸化位点是如何确定的？A2：一种特定的翻译后修饰通常会作用于一定的氨基酸，经修饰后，这一类氨基酸会增加相同的分子量，如，磷酸化肽段因加入磷酸化基团而产生+80 的质量偏移。基于……[阅读全文+]
- 代谢组学分析常见问题
- Q1. 常用的代谢物鉴定搜索的数据库有哪些？A1. 一般有HMDB、KEGG、METLIN等，精确度在10ppm 以内。如果数据库中有相应的二级谱图，则鉴定可以更加精确。Q2. 代谢全谱分析对样本个数有要求吗？A2. 临床样本个数每组建议不低于 30 个。模式生物及动植物样本，建议不少于 10 个。因为样本量少很有可能……[阅读全文+]
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