随着测序成本的降低,已知基因组序列的物种日益增多。众所周知,拟南芥是一种经典的模式物种,也是第一个完成全基因测序的植物物种。据不完全统计,从2000年到2018年2月,已测基因组的植物物种高达160种。下面,小编把最近整理的已测序植物物种(包含一个物种多次测序的情况),分享给您,看看有没有您研究的物种!
中文名 | 拉丁学名 | 科属信息 | 基因组大小 | 发表时间 | 刊物 |
买麻藤 | Gnetum parvifolium | 买麻藤科买麻藤属 | 4.11 Gb | 2018.01 | Nature Plants |
维柯萨 | Xerophyta viscosa | 翡若翠科 | 295.5Mb | 2017.12 | Nature Plants |
胡桃 | Juglans regia | 胡桃科胡桃属 | 667Mb | 2017.12 | The Plant Journal |
野生番茄(纯四代) | Solanum lycopersicum | 茄科番茄属 | 1.12Gb | 2017.10 | the Plant cell |
薄荷 | Mentha longifolia | 唇形科薄荷属 | 400Mb | 2017.10 | Molecular Plant |
博落回 | Macleaya cordata | 罂粟科博落回属 | 540.5Mb | 2017.10 | Molecular Plant |
茶树 | Camellia sinensis | 山茶科山茶属 | 3.02Gb | 2017.10 | Molecular Plant |
野生二粒小麦 | Triticum turgidum | 禾本科小麦属 | 10.1Gb | 2017.09 | Plant Genetics |
野生油橄榄 | Olea europaea | 木犀科木犀榄属 | 1.48Gb | 2017.08 | PNAS |
青稞(三代测序) | Hordeum vulgare | 禾本科大麦属 | 4.84Gb | 2017.08 | Plant Biotechnology Journal |
紫菜(单倍) | Porphyra | 紫球藻科紫菜属 | 87.7Mb | 2017.08 | PNAS |
榴莲 | Durio zibethinus | 木棉科榴莲属 | 738Mb | 2017.06 | Nature Genetics |
人参 | Panax ginseng | 五加科人参属 | 3.5Gb | 2017.06 | GigaScience |
三七 | Panax notoginseng | 五加科人参属 | 2.39Gb | 2017.05 | Molecular Plant |
甘薯(六倍体) | Dioscorea esculenta | 旋花科薯蓣属 | 4.4Gb | 2017.05 | Nature Plants |
山药 | Dioscorea rotundata | 薯蓣科薯蓣属 | 594Mb | 2017.05 | BMC Biology |
菠菜 | Spinacia oleracea | 藜科菠菜属 | 996Mb | 2017.04 | Nature Communications |
珍珠栗 | Pearl millet | 禾本科狼尾草属 | 1.76Gb | 2017.03 | Nature Biotechnology |
藜麦 | Chenopodium quinoa | 黎科黎属 | 1.5Gb | 2017.02 | Nature |
石榴 | Punica granatum | 石榴科石榴属 | 336Mb | 2017.02 | Plant Biotechnology Journal |
樱桃 | Prunus avium | 蔷薇科樱属 | 380 Mb | 2017.02 | DNA Research |
苦瓜 | Momordica charantia | 葫芦科苦瓜属 | 339 Mb | 2017.02 | DNA Research |
土瓶草 | Cephalotus follicularis | 土瓶草科土瓶草属 | 2.12Gb | 2017.02 | Nature Ecology & Evolution |
水稻 | Oryza glaberrima | 禾本科稻属 | 384Mb | 2016.12 | PNAS |
红枣 | jujube | 鼠李科枣属 | 351Mb | 2016.12 | PLOS Genetics |
银杏 | Ginkgo biloba | 银杏科银杏属 | 10.61Gb | 2016.11 | Gigascience |
牵牛花 | Pharbitis nil | 旋花科牵牛属 | 750Mb | 2016.11 | Nature Communications |
豇豆 | Vigna unguiculata | 豆科豇豆属 | 620Mb | 2016.10 | The Plant Journal |
碎米芥 | Cardamine hirsuta | 十字花科碎米荠属 | 198Mb | 2016.10 | Nature Plants |
甘草 | Glycyrrhiza uralensis | 豆科甘草属 | 381Mb | 2016.10 | The Plant Journal |
紫萍 | Spirodela polyrhiza | 浮萍科紫萍属 | 158Mb | 2016.09 | The Plant Journal |
芥菜 | Brassica juncea | 十字花科芸薹属 | 955Mb | 2016.09 | Nature Genetics |
鲁冰花(羽扇豆) | Lupinus micranthus | 豆科羽扇豆属 | 951Mb | 2016.08 | Plant Biotechnology Journal |
胡萝卜 | Daucus carota | 伞形科胡萝卜属 | 473Mb | 2016.05 | Nature Genetics |
玛卡 | Lepidium meyenii | 十字花科独行菜属 | 751Mb | 2016.05 | Molecular Plant |
橡胶树 | Hevea brasiliensis | 大戟科橡胶树属 | 1.46Gb | 2016.05 | Nature Plants |
花生 | Arachishypogaea | 豆科落花生属 | 2.7Gb | 2016.02 | Nature Genetics |
菜豆 | Phaseolus vulgaris | 豆科菜豆属 | 549.6Mb | 2016.02 | Genome Biology |
铁皮石斛 | Dendrobium catenatum | 兰科石斛属 | 1.11Gb | 2016.01 | Scientific Reports |
大叶藻 | Zostera marina | 眼子菜科大叶藻属 | 202.3Mb | 2016.01 | Nature |
丹参 | Salvia miltiorrhiza | 唇形科鼠尾草属 | 641Mb | 2015.12 | Gigascience |
长雄野生稻 | Oryza longistaminata | 禾本科稻属 | 347Mb | 2015.12 | molecular plant |
菠萝 | Ananas comosus | 凤梨科凤梨属 | 526Mb | 2015.11 | Nature Genetics |
浮萍 | Lemna minor L | 浮萍科浮萍属 | 481Mb | 2015.11 | biotechnol for biofuels |
复活草 | Oropetium thomaeum | 245Mb | 2015.11 | Nature | |
红花苜蓿 | Trifolium pratense | 豆科苜蓿属 | 420Mb | 2015.11 | Scientific Reports |
红车轴草 | Trifolium pratense | 豆科车轴草属 | 420Mb | 2015.11 | Scientific Reports |
蛋白核小球藻 | Chlorella pyrenoidesa | 绿藻门小球藻属 | 56.8Mb | 2015.10 | Plant Physiol |
赤豆(小豆) | Vigna angularis | 豆科豇豆属 | 542Mb | 2015.10 | PNAS |
海岛棉(长绒棉) | Gossypium barbadense | 锦葵科棉属 | 2.57Gb | 2015.09 | Scientific Reports |
黑麦草 | Lolium perenne | 禾本科黑麦草属 | 2Gb | 2015.09 | The Plant Journal |
辣木 | Moringa oleifera | 辣木科辣木属 | 289Mb | 2015.07 | Life Sciences |
茭白 | Zizania latifolia | 禾本科菰属 | 590Mb | 2015.06 | The Plant Journal |
圣罗勒 | Ocimum sanctum | 唇形科罗勒属 | 386Mb | 2015.05 | BMC Genomics |
四倍体陆地棉(棉花所版) | Gossypium hirsutum | 锦葵科棉属 | 2.43Gb | 2015.04 | Nature Biotechnology |
四倍体陆地棉(南农版) | Gossypium hirsutum | 锦葵科棉属 | 2.5Gb | 2015.04 | Nature Biotechnology |
海带 | Saccharina japonica | 海带科海带属 | 545Mb | 2015.04 | Nature Communications |
牛耳草 | Boea hygrometrica | 苦苣苔科旋蒴苣苔属 | 1.69Gb | 2015.04 | PNAS |
长春花 | Catharanthus roseus | 夹竹桃科长春花属 | 738Mb | 2015.04 | The Plant Journal |
科民茄(南美一种野生马铃薯) | Solanum commersonii | 茄科茄属 | 830Mb | 2015.04 | Plant Cell |
青稞 | Hordeum vulgare | 禾本科大麦属 | 3.89Gb | 2015.01 | PNAS |
赤豆(红小豆) | Vigna angularis | 豆科豇豆属 | 591Mb | 2015.01 | Scientific Reports |
黄花九轮草(莲香报春花) | Primula veris | 报春花科报春花属 | 479.2Nb | 2015.01 | Genome Biology |
铁皮石斛 | Dendrobium officinale | 兰科石斛属 | 1.66G | 2014.12 | Molecular Plant |
兰花 | Cymbidium ssp | 兰科兰属 | 1.16Gb | 2014.11 | Nature Genetics |
绿豆 | Vigna radiata | 豆科豇豆属 | 543Mb | 2014.11 | Nature Communications |
啤酒花 | Humulus lupulus | 桑科葎草属 | 2.57Gb | 2014.11 | Plant and Cell Physiology |
冬枣 | Ziziphus jujuba cv | 鼠李科枣属 | 444Mb | 2014.10 | Nature Communications |
五种纯合稻泛基因组 | Oryza glaberrima | 禾本科稻属 | 366-395Mb | 2014.10 | PNAS |
木薯 | Manihot esculenta Crantz | 大戟科木薯属 | 742Mb | 2014.10 | Nature Communications |
中果咖啡 | Coffea canephora | 茜草科咖啡属 | 710Mb | 2014.09 | Science |
大豆泛基因组 | Glycine max | 豆科大豆属 | 889-1118Mb | 2014.09 | NBT |
茄子 | Solanum melongena | 茄科茄属 | 1.127Gb | 2014.09 | DNA Research |
欧洲油菜 | Brassica napus | 十字花科芸薹属 | 1.13G | 2014.08 | Science |
非洲稻 | Oryza glaberrima | 禾本科稻属 | 316Mb | 2014.07 | Nature Genetics |
小麦B | Triticum aestivum | 禾本科小麦属 | 6.274Gb | 2014.07 | Science |
野生番茄 | Lycopersicon esculentum | 茄科番茄属 | 1.2Gb | 2014.07 | Nature Communications |
簸箕柳 | Salix suchowensis | 杨柳科柳属筐柳组 | 425Mb | 2014.07 | Cell Research |
野生大豆 | Glycine max | 豆科大豆属 | 1.17Gb | 2014.07 | Nature Communications |
巨桉树 | Eucalyptus grandis | 桃金娘科桉属 | 640Mb | 2014.06 | Nature |
栽培柑橘(柑橘酸橙杂交种) | clementine | 芸香科柑橘属 | 301.4Mb | 2014.06 | Nature Biotechnology |
菜豆 | Phaseolus vulgaris | 豆科菜豆属 | 587Mb | 2014.06 | Nature Genetics |
木本棉(A subgenome) | Gossypium arboreum | 锦葵科棉属 | 1.694Gb | 2014.05 | Nature Genetics |
烟草(3个品种) | Nicotiana tabacum | 茄科烟草属 | 4.41Gb, 4.60Gb, 4.57Gb | 2014.05 | Nature Communications |
甘蓝 | Brassica oleracea | 十字花科芸薹属 | 630Mb | 2014.05 | Nature Communications |
萝卜 | Raphanus sativus | 十字花科萝卜属 | 402Mb | 2014.05 | DNA Research |
辣椒(Zunla-1);墨西哥野生种Chiltepin | Capsicum annuum | 茄科辣椒属 | 3.35Gb, 3.48Gb, | 2014.03 | PNAS |
芝麻 | Sesamum indicum | 胡麻科胡麻属 | 274Mb | 2014.03 | Genome Biology |
火炬松 | Rhus Typhina Nutt | 漆树科盐肤木属 | 22Gb | 2014.03 | Genome Biology |
浮萍 | Lemna minor L | 浮萍科浮萍属 | 158Mb | 2014.02 | Nature Communications |
辣椒(韩国) | Capsicum annuum | 茄科辣椒属 | 3.04Gb | 2014.01 | Nature Genetics |
康乃馨 | Dianthus caryophyllus. | 石竹科石竹属 | 622Mb | 2013.12 | DNA Res. |
无油樟 | Amborella trichopoda | 无油樟科无油樟属 | 748Mb | 2013.12 | Science |
甜菜 | Beta vulgaris | 藜科甜菜属 | 731Mb | 2013.12 | Nature |
胡杨 | Populus euphratica | 杨柳科杨属 | 593Mb | 2013.11 | Nature Communications |
八倍体草莓 | Fragaria × ananassa | 蔷薇科草莓属 | 692Mb | 2013.11 | DNA Res. |
猕猴桃 | Actinidia Chinensis | 猕猴桃科猕猴桃属 | 758Mb | 2013.10 | Nature Communications |
桑树 | Morus notabilis | 桑科桑属 | 357Mb | 2013.09 | Nature Communications |
枣椰树 | Phoenix dactylifera | 棕榈科刺葵属 | 671Mb | 2013.08 | Nature Communications |
醉蝶花 | Tarenaya hassleriana | 醉蝶花科醉蝶花属 | 290Mb | 2013.08 | Plant Cell |
莲 | Nelumbo nucifera | 睡莲科莲属 | 879Mb | 2013.08 | Plant Journal |
虫黄藻 | Symbiodinium minutum | 甲藻门 | 1.5Gb | 2013.07 | Current Biology |
油棕榈 | Elaeis guineensis | 棕榈科油棕榈属 | 1.8Gb | 2013.07 | Nature |
海洋球石藻 | Emiliania huxleyi | 定鞭藻纲 | 141.7Mb | 2013.06 | Nature |
矮桦 | Betula potaninii Batal. | 桦木科桦木属 | 450Mb | 2013.06 | Molecular Ecology |
挪威云杉 | Picea abies | 松科云杉属 | 19.6Gb | 2013.05 | nature |
丝叶狸藻 | Utricularia gibba | 狸藻科狸藻属 | 82Mb | 2013.05 | Nature |
中国莲 | Nelumbo nucifera Gaertn | 睡莲科莲属 | 929 Mb | 2013.05 | Genome biology |
白云杉 | Picea abies | 松科云杉属 | 20.8Gb | 2013.05 | Bioinformatics |
短花药野生稻 | Oryza brachyantha | 禾本科稻属 | 342Mb-362Mb | 2013.03 | Nature Communications |
小麦A | Triticum urartu | 禾本科小麦属 | 4.94Gb | 2013.03 | Nature |
小麦D | grassAegilops tauschii | 禾本科小麦属 | 4.36Gb | 2013.03 | Nature |
桃树 | Prunus persica | 蔷薇科、桃属 | 265Mb | 2013.03 | Nature Genetics |
橡胶树 | Hevea brasiliensis | 大戟科橡胶树属 | 2.15Gb | 2013.02 | BMC Genomics |
毛竹 | Phyllostachys heterocycla | 竹科钢竹属 | 2.075Gb | 2013.02 | Nature Genetics |
鹰嘴豆 | Cicer arietinum | 豆科鹰嘴豆属 | 738Mb | 2013.01 | Nature biotechnology |
梅花 | Prunus mume | 蔷薇科杏属李属 | 280Mb | 2012.12 | Nature Communications |
梨 | Pyrus bretschneideri | 蔷薇科梨属 | 527Mb | 2012.11 | Genome Research |
西瓜 | Citrullus lanatus | 葫芦科西瓜属 | 425Mb | 2012.11 | Nature Genetics |
甜橙 | Citrus sinensis | 芸香科柑橘属 | 367Mb | 2012.11 | Nature Genetics |
小麦 | Triticum aestivum | 禾本科小麦属 | 17Gb | 2012.11 | Nature |
两种小型藻 | Bigelowiella natans;Guillardia theta | 95Mb;87Mb | 2012.11 | Nature | |
大麦 | Hordeum vulgare | 禾本科大麦属 | 5.1Gb | 2012.10 | Nature |
雷蒙德氏棉( D subgenome) | Gossypium raimondii | 锦葵科棉属 | 775.2Mb | 2012.08 | Nature Genetics |
甜瓜 | Cucumis melo | 葫芦科甜瓜属 | 450Mb | 2012.07 | PNAS |
亚麻 | Linum usitatissimum | 亚麻科亚麻属 | 373Mb | 2012.07 | Plant Journal |
盐芥 | Thellungiella salsuginea | 十字花科盐芥属 | 260Mb | 2012.07 | PNAS |
香蕉 | Musa acuminata | 芭蕉科芭蕉属 | 523Mb | 2012.07 | Nature |
谷子(豫谷) | Setaria italica | 禾本科、狗尾草属 | 400.9Mb | 2012.05 | Nature biotechnology |
谷子(张谷) | Setaria italica | 禾本科、狗尾草属 | 423Mb | 2012.05 | Nature biotechnology |
番茄 | Solanum lycopersicum | 茄科茄属 | 900Mb | 2012.05 | Nature |
蓝载藻 | Cyanophora paradoxa | 灰胞藻门 | 70Mb | 2012.02 | Science |
木豆 | Cajanus cajan | 豆科木豆属 | 833Mb | 2011.11 | Nature biotechnology |
蒺藜苜蓿 | Medicago truncatula | 豆科苜蓿属 | 500Mb | 2011.11 | Nature |
印度大麻 | Cannabis sativa | 大麻科大麻属 | 534Mb | 2011.10 | Genome biology |
条叶蓝芥 | Thellugiella parvula | 十字花科盐芥属 | 140Mb | 2011.08 | Nature Genetics |
白菜 | Brassica rapa | 十字花科芸薹属 | 485Mb | 2011.08 | Nature Genetics |
马铃薯(单) | Solanum tuberosum | 茄科茄属 | 844Mb | 2011.07 | Nature |
卷柏 | Selaginella moellendorffii | 卷柏科卷柏属 | 212Mb | 2011.05 | Science |
枣椰树 | Phoenix dactylifera | 棕榈科刺葵属 | 685Mb | 2011.05 | Nature biotechnology |
琴叶拟南芥 | Arabidopsis lyrata | 十字花科拟南芥属 | 206.7 Mb | 2011.05 | Nature Genetics |
野生草莓 | Fragaria vesca | 蔷薇科草莓属 | 240Mb | 2010.12 | Nature Genetics |
可可树 | Theobroma cacao | 梧桐科可可树属 | 430Mb | 2010.12 | Nature Genetics |
野生大豆 | Glycine soja Sieb | 豆科大豆属 | 915.4Mb | 2010.12 | PNAS |
麻风树 | Jatropha curcas | 大戟科麻风树属 | 410Mb | 2010.12 | DNA Res. |
小球藻 | Chlorella vulgaris | 小球藻科小球藻属 | 46Mb | 2010.09 | Plant Cell |
苹果 | Malus domestica | 蔷薇科苹果属 | 742Mb | 2010.09 | Nature Genetics |
蓖麻 | Ricinus communis L. | 大戟科蓖麻属 | 350Mb | 2010.08 | Nature Biotechnology |
团藻 | Volvox | 绿藻门团藻目团藻属 | 138Mb | 2010.07 | Science |
褐藻 | Phaeophyta | 褐藻门 | 196Mb | 2010.06 | Nature |
二穗短柄草 | Brachypodium distachyum | 禾本科短柄草属 | 260Mb | 2010.02 | Nature |
大豆 | Glycine max | 豆科大豆属 | 1100Mb | 2010.01 | Nature |
玉米 | Zea mays Linn. Sp. | 禾本科玉蜀黍属 | 2300Mb | 2009.11 | Science |
黄瓜 | Cucumis sativus L. | 葫芦科黄瓜属 | 350Mb | 2009.11 | Nature Genetics |
高粱 | Sorghum bicolor | 禾本科高粱属 | 730Mb | 2009.01 | Nature |
三角褐指藻 | Phaeodactylum tricornutum | 褐指藻科褐指藻属 | 27.4Mb | 2008.11 | Nature |
百脉根 | Lotusc orniculatus L. | 豆科百脉根属 | 472Mb | 2008.05 | DNA Res. |
番木瓜 | Carica Papaya L. | 番木瓜科番木瓜属 | 370Mb | 2008.04 | Nature |
小立碗藓 | Physcomitrella patens | 葫芦藓科小立碗藓属 | 480Mb | 2008.01 | Science |
葡萄 | Vitis vinifera | 葡萄科葡萄属 | 490Mb | 2007.09 | Nature |
衣藻 | Chlamydomonas | 衣藻科衣藻属 | 130Mb | 2007.01 | Science |
毛果杨 | Populus trichocarpa | 杨柳科杨属 | 480Mb | 2006.09 | Science |
粳稻 | O. sativa subsp. japonica | 禾本科稻属 | 466Mb | 2002.04 | Science |
籼稻 | O. sativa subsp. indica | 禾本科稻属 | 466Mb | 2002.04 | Science |
拟南芥 | Arabidopsis thaliala | 十字花科拟南芥属 | 125Mb | 2000.12 | Nature |
目前被测序物种较多,如有所疏漏,请您不要见怪,欢迎在评论里留言提醒。由于目前还没有一个基因组测序项目统一的注册系统,是否测序或正在测序完全靠项目申请或发表的文章来统计。测序物种的详细信息,大家也可以通过以下网站查询:
1、NCBI:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2、KEGG:http://www.genome.jp/kegg/catalog/org_list.html