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    关于博云

    你研究我物种测序了吗?

    随着测序成本的降低,已知基因组序列的物种日益增多。众所周知,拟南芥是一种经典的模式物种,也是第一个完成全基因测序的植物物种。据不完全统计,从2000年到2018年2月,已测基因组的植物物种高达160种。下面,小编把最近整理的已测序植物物种(包含一个物种多次测序的情况),分享给您,看看有没有您研究的物种!

    中文名

    拉丁学名

    科属信息

    基因组大小

    发表时间

    刊物

    买麻藤

    Gnetum parvifolium

    买麻藤科买麻藤属

    4.11 Gb

    2018.01

    Nature Plants

    维柯萨

    Xerophyta viscosa

    翡若翠科

    295.5Mb

    2017.12

    Nature Plants

    胡桃

    Juglans regia

    胡桃科胡桃属

    667Mb

    2017.12

    The Plant Journal

    野生番茄(纯四代)

    Solanum lycopersicum

    茄科番茄属

    1.12Gb

    2017.10

    the Plant cell

    薄荷

    Mentha longifolia

    唇形科薄荷属

    400Mb

    2017.10

    Molecular Plant

    博落回

    Macleaya cordata

    罂粟科博落回属

    540.5Mb

    2017.10

    Molecular Plant

    茶树

    Camellia sinensis

    山茶科山茶属

    3.02Gb

    2017.10

    Molecular Plant

    野生二粒小麦

    Triticum turgidum

    禾本科小麦属

    10.1Gb

    2017.09

    Plant Genetics

    野生油橄榄

    Olea europaea

    木犀科木犀榄属

    1.48Gb

    2017.08

    PNAS

    青稞(三代测序)

    Hordeum vulgare

    禾本科大麦属

    4.84Gb

    2017.08

    Plant Biotechnology Journal

    紫菜(单倍)

    Porphyra

    紫球藻科紫菜属

    87.7Mb

    2017.08

    PNAS

    榴莲

    Durio zibethinus

    木棉科榴莲属

    738Mb

    2017.06

    Nature Genetics

    人参

    Panax ginseng

    五加科人参属

    3.5Gb

    2017.06

    GigaScience

    三七

    Panax notoginseng

    五加科人参属

    2.39Gb

    2017.05

    Molecular Plant

    甘薯(六倍体)

    Dioscorea esculenta

    旋花科薯蓣属

    4.4Gb

    2017.05

    Nature Plants

    山药

    Dioscorea rotundata

    薯蓣科薯蓣属

    594Mb

    2017.05

    BMC Biology

    菠菜

    Spinacia oleracea

    藜科菠菜属

    996Mb

    2017.04

    Nature Communications

    珍珠栗

    Pearl millet

    禾本科狼尾草属

    1.76Gb

    2017.03

    Nature Biotechnology

    藜麦

    Chenopodium quinoa

    黎科黎属

    1.5Gb

    2017.02

    Nature

    石榴

    Punica granatum

    石榴科石榴属

     336Mb

    2017.02

    Plant Biotechnology Journal

    樱桃

    Prunus avium

    蔷薇科樱属

    380 Mb

    2017.02

    DNA Research

    苦瓜

    Momordica charantia

    葫芦科苦瓜属

    339 Mb

    2017.02

    DNA Research

    土瓶草

    Cephalotus follicularis

    土瓶草科土瓶草属

    2.12Gb

    2017.02

    Nature Ecology & Evolution

    水稻

    Oryza glaberrima

    禾本科稻属

    384Mb

    2016.12

    PNAS

    红枣

    jujube

    鼠李科枣属

    351Mb

    2016.12

    PLOS Genetics

    银杏

    Ginkgo biloba

    银杏科银杏属

    10.61Gb

    2016.11

    Gigascience

    牵牛花

    Pharbitis nil

    旋花科牵牛属

    750Mb

    2016.11

    Nature Communications

    豇豆

    Vigna unguiculata

    豆科豇豆属

    620Mb

    2016.10

    The Plant Journal

    碎米芥

    Cardamine hirsuta

    十字花科碎米荠属

    198Mb

    2016.10

    Nature Plants

    甘草

    Glycyrrhiza uralensis

    豆科甘草属

    381Mb

    2016.10

    The Plant Journal

    紫萍

    Spirodela polyrhiza

    浮萍科紫萍属

    158Mb

    2016.09

    The Plant Journal

    芥菜

    Brassica juncea

    十字花科芸薹属

    955Mb

    2016.09

    Nature Genetics

    鲁冰花(羽扇豆)

    Lupinus micranthus

    豆科羽扇豆属

    951Mb

    2016.08

    Plant Biotechnology Journal

    胡萝卜

    Daucus carota

    伞形科胡萝卜属

    473Mb

    2016.05

    Nature Genetics

    玛卡

    Lepidium meyenii

    十字花科独行菜属

    751Mb

    2016.05

    Molecular Plant

    橡胶树

    Hevea brasiliensis

    大戟科橡胶树属

    1.46Gb

    2016.05

    Nature Plants

    花生

    Arachishypogaea

    豆科落花生属

    2.7Gb

    2016.02

    Nature Genetics

    菜豆

    Phaseolus vulgaris

    豆科菜豆属

    549.6Mb

    2016.02

    Genome Biology

    铁皮石斛

    Dendrobium catenatum

    兰科石斛属

    1.11Gb

    2016.01

    Scientific Reports

    大叶藻

    Zostera marina

    眼子菜科大叶藻属

    202.3Mb

    2016.01

    Nature

    丹参

    Salvia miltiorrhiza

    唇形科鼠尾草属

    641Mb

    2015.12

    Gigascience

    长雄野生稻

    Oryza longistaminata

    禾本科稻属

    347Mb

    2015.12

    molecular plant

    菠萝

    Ananas comosus

    凤梨科凤梨属

    526Mb

    2015.11

    Nature Genetics

    浮萍

    Lemna minor L

    浮萍科浮萍属

    481Mb

    2015.11

    biotechnol for biofuels

    复活草

    Oropetium thomaeum


    245Mb

    2015.11

    Nature

    红花苜蓿

    Trifolium pratense

    豆科苜蓿属

    420Mb

    2015.11

    Scientific Reports

    红车轴草

    Trifolium pratense

    豆科车轴草属

    420Mb

    2015.11

    Scientific Reports

    蛋白核小球藻

    Chlorella pyrenoidesa

    绿藻门小球藻属

    56.8Mb

    2015.10

    Plant Physiol

    赤豆(小豆)

    Vigna angularis

    豆科豇豆属

    542Mb

    2015.10

    PNAS

    海岛棉(长绒棉)

    Gossypium barbadense

    锦葵科棉属

    2.57Gb

    2015.09

    Scientific Reports

    黑麦草

    Lolium perenne

    禾本科黑麦草属

    2Gb

    2015.09

    The Plant Journal

    辣木

    Moringa oleifera

    辣木科辣木属

    289Mb

    2015.07

    Life Sciences

    茭白

    Zizania latifolia

    禾本科菰属

    590Mb

    2015.06

    The Plant Journal

    圣罗勒

    Ocimum sanctum

    唇形科罗勒属

    386Mb

    2015.05

    BMC Genomics

    四倍体陆地棉(棉花所版)

    Gossypium hirsutum

    锦葵科棉属

    2.43Gb

    2015.04

    Nature Biotechnology

    四倍体陆地棉(南农版)

    Gossypium hirsutum

    锦葵科棉属

    2.5Gb

    2015.04

    Nature Biotechnology

    海带

    Saccharina japonica

    海带科海带属

    545Mb

    2015.04

    Nature Communications

    牛耳草

    Boea hygrometrica

    苦苣苔科旋蒴苣苔属

    1.69Gb

    2015.04

    PNAS

    长春花

    Catharanthus roseus

    夹竹桃科长春花属

    738Mb

    2015.04

    The Plant Journal

    科民茄(南美一种野生马铃薯)

     Solanum commersonii

    茄科茄属

    830Mb

    2015.04

    Plant Cell

    青稞

    Hordeum vulgare

    禾本科大麦属

    3.89Gb

    2015.01

    PNAS

    赤豆(红小豆)

    Vigna angularis

    豆科豇豆属

    591Mb

    2015.01

    Scientific Reports

    黄花九轮草(莲香报春花)

    Primula veris

    报春花科报春花属

    479.2Nb

    2015.01

    Genome Biology

    铁皮石斛

    Dendrobium officinale

    兰科石斛属

    1.66G

    2014.12

    Molecular Plant

    兰花

    Cymbidium ssp

    兰科兰属

    1.16Gb

    2014.11

    Nature Genetics

    绿豆

    Vigna radiata

    豆科豇豆属

    543Mb

    2014.11

    Nature Communications

    啤酒花

    Humulus lupulus

    桑科葎草属

    2.57Gb

    2014.11

    Plant and Cell Physiology

    冬枣

    Ziziphus jujuba cv

    鼠李科枣属

    444Mb

    2014.10

    Nature Communications

    五种纯合稻泛基因组

    Oryza glaberrima

    禾本科稻属

    366-395Mb

    2014.10

    PNAS

    木薯

    Manihot esculenta Crantz

    大戟科木薯属

    742Mb

    2014.10

    Nature Communications

    中果咖啡

    Coffea canephora

    茜草科咖啡属

    710Mb

    2014.09

    Science

    大豆泛基因组

    Glycine max

    豆科大豆属

    889-1118Mb

    2014.09

    NBT

    茄子

    Solanum melongena

    茄科茄属

    1.127Gb

    2014.09

    DNA Research

    欧洲油菜

    Brassica napus

    十字花科芸薹属

    1.13G

    2014.08

    Science

    非洲稻

    Oryza glaberrima

    禾本科稻属

    316Mb

    2014.07

    Nature Genetics

    小麦B

    Triticum aestivum

    禾本科小麦属

    6.274Gb

    2014.07

    Science

    野生番茄

    Lycopersicon esculentum

    茄科番茄属

    1.2Gb

    2014.07

    Nature Communications

    簸箕柳

    Salix suchowensis

    杨柳科柳属筐柳组

    425Mb

    2014.07

    Cell Research

    野生大豆

    Glycine max

    豆科大豆属

    1.17Gb

    2014.07

    Nature Communications

    巨桉树

    Eucalyptus grandis

    桃金娘科桉属

    640Mb

    2014.06

    Nature

    栽培柑橘(柑橘酸橙杂交种)

    clementine

    芸香科柑橘属

    301.4Mb

    2014.06

    Nature Biotechnology

    菜豆

    Phaseolus vulgaris

    豆科菜豆属

    587Mb

    2014.06

    Nature Genetics

    木本棉(A subgenome)

    Gossypium arboreum

    锦葵科棉属

    1.694Gb

    2014.05

    Nature Genetics

    烟草(3个品种)

    Nicotiana tabacum

    茄科烟草属

    4.41Gb, 4.60Gb, 4.57Gb

    2014.05

    Nature Communications

    甘蓝

    Brassica oleracea

    十字花科芸薹属

    630Mb

    2014.05

    Nature Communications

    萝卜

    Raphanus sativus

    十字花科萝卜属

    402Mb

    2014.05

    DNA Research

    辣椒(Zunla-1);墨西哥野生种Chiltepin

    Capsicum annuum

    茄科辣椒属

    3.35Gb, 3.48Gb,

    2014.03

    PNAS

    芝麻

    Sesamum indicum

    胡麻科胡麻属

    274Mb

    2014.03

    Genome Biology

    火炬松

    Rhus Typhina Nutt

    漆树科盐肤木属

    22Gb

    2014.03

    Genome Biology

    浮萍

    Lemna minor L

    浮萍科浮萍属

    158Mb

    2014.02

    Nature Communications

    辣椒(韩国)

    Capsicum annuum

    茄科辣椒属

    3.04Gb

    2014.01

    Nature Genetics

    康乃馨

    Dianthus caryophyllus.

    石竹科石竹属

    622Mb

    2013.12

    DNA Res.

    无油樟

    Amborella trichopoda

    无油樟科无油樟属

    748Mb

    2013.12

    Science

    甜菜

    Beta vulgaris

    藜科甜菜属

    731Mb

    2013.12

    Nature

    胡杨

    Populus euphratica

    杨柳科杨属

    593Mb

    2013.11

    Nature Communications

    八倍体草莓

    Fragaria × ananassa

    蔷薇科草莓属

    692Mb

    2013.11

    DNA Res.

    猕猴桃

    Actinidia Chinensis

    猕猴桃科猕猴桃属

    758Mb

    2013.10

    Nature Communications

    桑树

    Morus notabilis

    桑科桑属

    357Mb

    2013.09

    Nature Communications

    枣椰树

    Phoenix dactylifera

    棕榈科刺葵属

    671Mb

    2013.08

    Nature Communications

    醉蝶花

    Tarenaya hassleriana

    醉蝶花科醉蝶花属

    290Mb

    2013.08

    Plant Cell

    Nelumbo nucifera

    睡莲科莲属

    879Mb

    2013.08

    Plant Journal

    虫黄藻

    Symbiodinium minutum

    甲藻门

    1.5Gb

    2013.07

    Current Biology

    油棕榈

    Elaeis guineensis

    棕榈科油棕榈属

    1.8Gb

    2013.07

    Nature

    海洋球石藻

    Emiliania huxleyi

    定鞭藻纲

    141.7Mb

    2013.06

    Nature

    矮桦

    Betula potaninii Batal.

    桦木科桦木属

    450Mb

    2013.06

    Molecular Ecology

    挪威云杉

    Picea abies

    松科云杉属

    19.6Gb

    2013.05

    nature

    丝叶狸藻

    Utricularia gibba

    狸藻科狸藻属

    82Mb

    2013.05

    Nature

    中国莲

    Nelumbo nucifera Gaertn

    睡莲科莲属

    929 Mb

    2013.05

    Genome biology

    白云杉

    Picea abies

    松科云杉属

    20.8Gb

    2013.05

    Bioinformatics

    短花药野生稻

    Oryza brachyantha

    禾本科稻属

    342Mb-362Mb

    2013.03

    Nature Communications

    小麦A

    Triticum urartu

    禾本科小麦属

    4.94Gb

    2013.03

    Nature

    小麦D

    grassAegilops tauschii

    禾本科小麦属

    4.36Gb

    2013.03

    Nature

    桃树

    Prunus persica

    蔷薇科、桃属

    265Mb

    2013.03

    Nature Genetics

    橡胶树

    Hevea brasiliensis

    大戟科橡胶树属

    2.15Gb

    2013.02

    BMC Genomics

    毛竹

    Phyllostachys heterocycla

    竹科钢竹属

    2.075Gb

    2013.02

    Nature Genetics

    鹰嘴豆

    Cicer arietinum

    豆科鹰嘴豆属

    738Mb

    2013.01

    Nature biotechnology

    梅花

    Prunus mume

    蔷薇科杏属李属

    280Mb

    2012.12

    Nature Communications

    Pyrus bretschneideri

    蔷薇科梨属

    527Mb

    2012.11

    Genome Research

    西瓜

    Citrullus lanatus

    葫芦科西瓜属

    425Mb

    2012.11

    Nature Genetics

    甜橙

    Citrus sinensis

    芸香科柑橘属

    367Mb

    2012.11

    Nature Genetics

    小麦

    Triticum aestivum

    禾本科小麦属

    17Gb

    2012.11

    Nature

    两种小型藻

    Bigelowiella natans;Guillardia theta


    95Mb;87Mb

    2012.11

    Nature

    大麦

    Hordeum vulgare

    禾本科大麦属

    5.1Gb

    2012.10

    Nature

    雷蒙德氏棉( D subgenome)

    Gossypium raimondii

    锦葵科棉属

    775.2Mb

    2012.08

    Nature Genetics

    甜瓜

    Cucumis melo

    葫芦科甜瓜属

    450Mb

    2012.07

    PNAS

    亚麻

    Linum usitatissimum

    亚麻科亚麻属

    373Mb

    2012.07

    Plant Journal

    盐芥

    Thellungiella salsuginea

    十字花科盐芥属

    260Mb

    2012.07

    PNAS

    香蕉

    Musa acuminata

    芭蕉科芭蕉属

    523Mb

    2012.07

    Nature

    谷子(豫谷)

    Setaria italica

    禾本科、狗尾草属

    400.9Mb

    2012.05

    Nature biotechnology

    谷子(张谷)

    Setaria italica

    禾本科、狗尾草属

    423Mb

    2012.05

    Nature biotechnology

    番茄

    Solanum lycopersicum

    茄科茄属

    900Mb

    2012.05

    Nature

    蓝载藻

    Cyanophora paradoxa

    灰胞藻门

    70Mb

    2012.02

    Science

    木豆

    Cajanus cajan

    豆科木豆属

    833Mb

    2011.11

    Nature biotechnology

    蒺藜苜蓿

    Medicago truncatula

    豆科苜蓿属

    500Mb

    2011.11

    Nature

    印度大麻

    Cannabis sativa

    大麻科大麻属

    534Mb

    2011.10

    Genome biology

    条叶蓝芥

    Thellugiella parvula

    十字花科盐芥属

    140Mb

    2011.08

    Nature Genetics

    白菜

    Brassica rapa

    十字花科芸薹属

    485Mb

    2011.08

    Nature Genetics

    马铃薯(单)

    Solanum tuberosum

    茄科茄属

    844Mb

    2011.07

    Nature

    卷柏

    Selaginella moellendorffii

    卷柏科卷柏属

    212Mb

    2011.05

    Science

    枣椰树

    Phoenix dactylifera

    棕榈科刺葵属

    685Mb

    2011.05

    Nature biotechnology

    琴叶拟南芥

    Arabidopsis lyrata

    十字花科拟南芥属

    206.7 Mb

    2011.05

    Nature Genetics

    野生草莓

    Fragaria vesca

    蔷薇科草莓属

    240Mb

    2010.12

    Nature Genetics

    可可树

    Theobroma cacao

    梧桐科可可树属

    430Mb

    2010.12

    Nature Genetics

    野生大豆

    Glycine soja Sieb

    豆科大豆属

    915.4Mb

    2010.12

    PNAS

    麻风树

    Jatropha curcas

    大戟科麻风树属

    410Mb

    2010.12

    DNA Res.

    小球藻

    Chlorella vulgaris

    小球藻科小球藻属

    46Mb

    2010.09

    Plant Cell

    苹果

    Malus domestica

    蔷薇科苹果属

    742Mb

    2010.09

    Nature Genetics

    蓖麻

    Ricinus communis L.

    大戟科蓖麻属

    350Mb

    2010.08

    Nature Biotechnology

    团藻

    Volvox

    绿藻门团藻目团藻属

    138Mb

    2010.07

    Science

    褐藻

    Phaeophyta

    褐藻门

    196Mb

    2010.06

    Nature

    二穗短柄草

    Brachypodium distachyum

    禾本科短柄草属

    260Mb

    2010.02

    Nature

    大豆

    Glycine max

    豆科大豆属

    1100Mb

    2010.01

    Nature

    玉米

    Zea mays Linn. Sp.

    禾本科玉蜀黍属

    2300Mb

    2009.11

    Science

    黄瓜

    Cucumis sativus L.

    葫芦科黄瓜属

    350Mb

    2009.11

    Nature Genetics

    高粱

    Sorghum bicolor

    禾本科高粱属

    730Mb

    2009.01

    Nature

    三角褐指藻

    Phaeodactylum tricornutum

    褐指藻科褐指藻属

    27.4Mb

    2008.11

    Nature

    百脉根

    Lotusc orniculatus L.

    豆科百脉根属

    472Mb

    2008.05

    DNA Res.

    番木瓜

    Carica Papaya L.

    番木瓜科番木瓜属

    370Mb

    2008.04

    Nature

    小立碗藓

    Physcomitrella patens

    葫芦藓科小立碗藓属

    480Mb

    2008.01

    Science

    葡萄

    Vitis vinifera

    葡萄科葡萄属

    490Mb

    2007.09

    Nature

    衣藻

    Chlamydomonas

    衣藻科衣藻属

    130Mb

    2007.01

    Science

    毛果杨

    Populus trichocarpa

    杨柳科杨属

    480Mb

    2006.09

    Science

    粳稻

    O. sativa subsp. japonica

    禾本科稻属

    466Mb

    2002.04

    Science

    籼稻

    O. sativa subsp. indica

    禾本科稻属

    466Mb

    2002.04

    Science

    拟南芥

    Arabidopsis thaliala

    十字花科拟南芥属

    125Mb

    2000.12

    Nature 

    目前被测序物种较多,如有所疏漏,请您不要见怪,欢迎在评论里留言提醒。由于目前还没有一个基因组测序项目统一的注册系统,是否测序或正在测序完全靠项目申请或发表的文章来统计。测序物种的详细信息,大家也可以通过以下网站查询:

    1、NCBI:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

    2、KEGG:http://www.genome.jp/kegg/catalog/org_list.html

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