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全转录组关联分析常见问题

Q1:转录组关联分析必须同时对所有RNA进行建库测序吗? 

A1:不是的,可以根据课题实际情况,结合所研究的物种是否有已知的数据(miRNA数据库、已知的lncRNA或circRNA序列等)来设计需要测序的RNA种类。 


Q2:转录组关联分析可以怎么设计? 

A2:可以是mRNA与miRNA关联分析,也可以是mRNA+miRNA+lncRNA/circRNA全关联分析。老师可以根据课题的研究目的来选择。 


Q3:什么是ceRNA? 

A3:ceRNA (competing endogenous RNAs)是指竞争性内源RNA机制,ceRNA揭示了RNA间相互作用的新机制,2011年由Pier Paolo Pandolfi等提出。该机制的核心理论是细胞内存在ceRNA,这些ceRNA分子(mRNA,lncRNA、circRNA、假基因等)能够通过miRNA应答元件(MicroRNA Response Element,MRE)竞争结合相同的miRNA以达到调节彼此表达水平。

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