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芯片基因分型常见问题

Q1:基于芯片的基因分型与高通量测序相比有何优劣?

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Q2:全基因组检测芯片,与iSelect芯片该如何选择?

A2:全基因组检测芯片适于适用于标准SNP研究项目每张芯片300,000-5,000,000SNP位点。iSelectHD为定制化芯片,便于客户进行定制化研究。iSelectHD的每张芯片可研究3,000–1,000,000个SNP位点。


Q3:定制芯片的样本量选择有何要求?

A3:由于威九国际向Illumina订购芯片的时候有一定的样本量限制,iSelectHD芯片需要1152个样本起订(相当于24合1的芯片48张),适用于超过3000个位点的情况;而全基因组芯片为4张芯片起订。


Q4:定制芯片需提供哪些信息?

A4:需要提供位点信息和实验样品。其中位点信息包括:SNP位点编号(如,rs12693932),如果没有SNP编号,请提供:SNP的突变位点和SNP位点两侧的侧翼序列60bp以上,重点想得到数据的位点请特别说明。


Q5:Illumina的芯片能否检测CNV?

A5:Illumina的SNP芯片能够检测CNV,准确性也很高。





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