Q1:16S产品有样品数量的要求,需要所有样品准备好了才能进行测序分析吗?
A1:从科学的角度来讲,最好能够整批样品同时测序分析,既可以减少不同批次间的系统误差,还能节省项目周期。若样品准备有困难,也可以分批次启动,但需与客户说明由此可能带来的系统误差问题。
Q2:若关注环境中的真核微生物多样性,ITS测序和18S测序哪个更好?
A2:ITS测序主要是针对真菌多样性的研究,注释准确度高;18S测序针对的是真核微生物,注释到的范围广,但是就真菌来说精确度相对较低;可根据研究目的合理选择测序方案。
Q3:扩增子与宏基因组有何区别?
A3:扩增子主要分为16S、18S、ITS测序,关注环境样本中的物种组成,该技术物美价廉,实用性高。宏基因组关注环境样本中的物种组成、功能组成及代谢通路等信息,该技术深入挖掘环境样本功能层面的信息。
Q4:16S测序选哪个区域比较合适?
A4:目前并没有研究表明哪个测序区域更好。有文章研究表明土壤样本,16S V4区(515F-806R)比较适合做扩增子研究,可检测的物种多样性更丰富,并且可重复性强。