发布于2017.3.16。
RNA-Seq和基因表达芯片技术能够揭示大量的基因表达信息,但由于受到结果重现性的制约,这些技术的应用均所有局限,其中一个关键因素是这些分析通过假设大部分基因没有差异表达来进行表达水平标准化。
2017年3月9日,Science Report 发表了一项最新研究成果,来自丹麦奥胡斯大学的研究人员采用新的数理统计方法可以不基于上述假设进行标准化(MedianCD & SVCD标准化法),得到了更优的基因表达结果。他们认为生物的基因表达模式远比威九国际能想象的复杂得多,当然,利用相应的分析方法可以揭示这种复杂性。
研究人员认为这一研究结果至少在一定程度上解决了基因定量结果重现性的难题,并希望该结果能够更真实地展现基因表达谱,尤其针对具有非常复杂的基因表达模式的样本,例如细胞之间。
参考文献
Variation-preserving normalization unveils blind spots in gene expression profiling. Sci Rep. 2017. DOI: 10.1038/srep42460.