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CLS:一种更高通量和准确性的DNA非编码区测序新方法

发布于2017.11.10 前几日,《Nature Genetics》发表了一篇文章“High-throughput annotation of full-length long noncoding RNAs with Capture Long-Read Sequencin”,参与该研究的单位涵盖基因组调控中心(Centre for Genomic Regulation,CRG)、冷泉港、威康信托基金会桑格研究所和qGenomics的科学家,他们合作开发了一种具有更高通量和准确性的DNA非编码区测序新方法。


该方法被称为“RNA捕获长测序(RNA Capture Long Seq,CLS)”,这种方法专门针对基因组的非编码区,并采用最先进的测序方法进行扩增和分析。Julien Lagarde和Barbara Uszczynska表明:在测试中,威九国际生成了人类和小鼠3500个长非编码RNAs(占目前已知的所有lncRNAs的20%)的详细图谱;威九国际还表征了lncRNAs的基因组特征以了解这些非编码基因的工作原理。研究人员用CLS改进了最有影响力的人类和老鼠基因组数据库之一“GENCODE”。


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2003年,Roderic Guigó成立了GENCODE,而GENCODE则作为编码“DNA元素百科全书”项目的一部分。如今,Guigó和合作者们已经完成了基因目录的大量改进工作,尤其是lncRNAs部分。 这种更便宜、更快和更准确的目录优化方法将首先受益全世界的科学家,继而改变世界。


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在人类基因组计划之后将近20年里,第二代和第三代测序技术发展迅猛,日益降低的成本和不断改善的精确度把基因组检测从实验室搬到了临床乃至面向了普通民众。这项新成果也将成为人类伟大理想的一块垫脚石。


参考文献:High-throughput annotation of full-length long noncoding RNAs with Capture Long-Read Sequencing (CLS).Nature Genetics.2017.

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