Q1:目前可以做circRNA测序的物种有哪些?
A1:具有参考基因组序列的动植物等均可进行circRNA测序,目前主要集中在模式物种。
Q2:如何分离得到circRNA?
A2:circRNA具有闭合环状结构,比线性RNA更加稳定,其分离方法主要是先去除rRNA,再用RNase R消化线性RNA。
Q3:circRNA一般会做哪些内容的分析?
A3:circRNA的预测、注释、表达量分析、来源基因的GO/KEGG富集分析及与miRNA的靶向关系分析等。
Q4:如何鉴定circRNA?
A4:通过寻找反向剪接的reads,即back-splicing reads来鉴定circRNA。