Fosmid文库构建可用于全基因组的物理图谱构建、基因功能及表达调控的研究、重要性状基因的图位克隆和基因结构及功能的分析等。Fosmid文库构建应用了改进的Cosmid质粒载体，即将pBAC引入PUCcos融合后构建的载体系统。
图1 Fosmid文库构建流程图
图2 Shotgun文库构建流程图
研究内容
Fosmid文库：文库构建完成后进行分析鉴定，包括库容量、插入片段大小、随机性、Blast结果等。
Shotgun文库：文库构建完成后进行分析鉴定，包括库容量、插入片段大小、随机性、Blast结果等；大规模测序组装完成后，进行组装评价，包括平均覆盖度、低质量区域、特殊结构等。
合格指标
Fosmid文库：插入片段大小约35-40Kb，空载率 ≤ 5%； 库容量=基因组大小×覆盖度/平均片段大小，保证初始库容为2万。
Shotgun文库：构建文库所用载体为 pUC118， 转化后克隆 80 % 以上插入片段的平均长度在要求范围内；库容=基因组大小*覆盖度/平均片段大小。
测序：精细图（ Phase II）： 1 个 Scafford、 2 个 end、 ≤5 gap。
提交结果
Fosmid文库：96或384孔保菌板和文库送检报告。
Shotgun文库：建库项目：所有转化菌液及结题报告；建库+测序项目：拼接结果及结题报告。
即将推出。
文库构建策略
Fosmid文库：文库插入片段大小在 35 kb-45 kb。
Shotgun文库：文库插入片段大小在 2-3kb、 4-6kb、 6-8kb。
送样建议
Fosmid文库：
样品类型： DNA 样品或组织样品；
样品需求量： DNA 总量 ≥50 μg（随库容量增加而增加）， DNA 主带≥40 Kb；
样品浓度： ≥50 ng/μl；
样品纯度： OD260/280= 1.8~2.0； DNA 溶液肉眼观察无明显杂质；
注意事项：植物组织样品，最好是黄化苗；动物组织样品，最好为新鲜动物组织。二者均需取样后液氮保存，干冰运输；包装后产物及侵染后的菌不宜放置太长时间，需要第一时间涂菌，否则阳性克隆数很难保证；如客户还需进行后续的测序，尽可能保菌和测序同时进行。
Shotgun文库：
样品类型： DNA 样品、组织样品或菌液；
样品需求量： DNA 总量≥20 μg；
样品浓度： ≥50 ng/μl；
样品纯度： OD260/280=1.8~2.0；
注意事项：植物组织样品，最好是黄化苗；动物组织样品，最好为新鲜动物组织。病毒类、叶绿体、线粒体、噬菌体及野生质粒等样品需提供纯化后 DNA 样品。
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