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图1  sRNA片段的长度分布统计

图2  所注释的 contigs 维恩图

经典案例

小RNA高通量测序鉴定玉米病毒 Virology Journal. 2015.

Identification and characterization of a maize-associated mastrevirus in China by deep sequencing small RNA populations. Virology Journal. 2015, DOI 10.1186/s12985-015-0384-3 

玉米条纹团聚病毒（MSRV）是双生病毒科中玉米条纹病毒属的成员，除玉米条纹病毒MSV之外， MSRV是另一种引起玉米条纹病的病毒。在本研究开展之前，仅在留尼旺和尼日利亚发现过两种MSRV病毒。本研究利用小RNA深度测序分析云南玉米条纹病相关的病毒，通过将来源于病毒的siRNA与Nr数据库比对，首次发现了我国的玉米条纹团聚病毒，即MSRV-YN，该结果可为针对MSRV-YN的抗病毒RNAi设计策略提供理论指导。

图1 MSRV-YN鉴定流程

图2 MSRV-YN结构及保守核酸序列分析

图3 MSRV-YN siRNA特征分析

推荐文献

[1] Identification, Characterization and Full-Length Sequence Analysis of a Novel Polerovirus Associated with Wheat Leaf Yellowing Disease. Frontiers in Microbiology. 2017

[2] Characterization of a Novel Polerovirus Infecting Maize in China. Viruses. 2016

[3] Complete sequence and diversity of a maizeassociated Polerovirus in East Africa. Virus Genes. 2018

[4] Deep Sequencing of Small RNAs in Tomato for Virus and Viroid Identification and Strain Differentiation. PLoS ONE. 2012