代谢组学(metabonomics/metabolomics)是继基因组学和蛋白质组学之后新兴发展起来的学科,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。其研究对象是相对分子质量 1000 DA 以内的小分子物质,如脂类、酮类、有机酸等。


PLS-DA score plot

PLS-DA S-plot
经典案例
血清代谢组学揭示充血性心力衰竭和冠状动脉心脏病的差异表达代谢物 Biomarkers.2013
Serum Metabolomics Reveal potential Biomarkers and Variation of Lipid Metabolism between Coronary Artery Disease and Congestive Heart Failure: A Pilot Study. Biomarkers.2013, doi: 10.3109/1354750 X.2013.781222.
本文通过代谢全谱分析的方法研究了充血性心力衰竭和冠状动脉心脏病之间的差异表达代谢物,共鉴定到 2326个质谱峰,通过化学计量学分析确定12种显著性差异代谢物。此外,作者分析了4种游离脂肪酸在冠状动脉疾病病人、健康人和充血性心力衰竭组中的含量变化,发现与充血性心力衰竭相比,冠状动脉疾病患者的游离脂肪酸浓度显著下降,说明和冠状动脉疾病有关的代谢物在脂质代谢、鞘脂代谢、氨基酸代谢中扮演很重要的角色。作者认为脂质分子代谢和信号通路可能影响心脏的功能。

图1 OPLS-DA plot图

图2 4种游离脂肪酸在不同样本中的含量
推荐文献
[1] Simultaneous UPLC–MS/MS assay for the detection of the traditionaantipsychotics haloperidol, fluphenazine, perphenazine,andthiothixene in serum and plasma. ClinChimActa. 2013, doi: 10.1016/j.cca.2013.04.014.
[2] Effect of traditional Chinese medicine berberine on type 2 diabetes based on comprehensive metabonomics. Talanta. 2010, doi: 10.1016/j.talanta.2010.01.015.
质谱平台

TripleTOF 5600,AB SCIEX | 
Q Exactive, Thermo |
项目周期
60工作日
送样建议
样品类型 | 总量 | 备注 |
新鲜动植物(含昆虫)组织 | 100mg | 采集后,立即置入液氮中低温冷冻保存 |
微生物(含细胞) | 菌体10mg;菌液1ml;
细胞107个 | 微生物迅速用液氮或者有机溶剂(-40℃)灭活,使其代谢瞬
间停止 |
血浆、血清 | 500 µl | 采集后,立即置入‐80 ℃低温冷冻保存 |
尿液 | 50mL | 采集后,立即置入‐80 ℃低温冷冻保存 |
FAQ
代谢组学分析常见问题