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Nature Methods发表让基因表达定量更精确的新算法
发布于2017.3.13。近日,Nature Methods发表了一种让基因表达定量更准确的算法,来自卡耐基梅隆大学和哈佛大学医学院附属丹娜法伯癌症研究院等的研究人员将他们开发的该算法称为Salmon(鲑鱼),因为该算法可以非常快速地分析处理数据偏向性对表达量计算的影响,如同鲑鱼一般敏捷迅速。图1 Salmon分析流程……
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空间转录组分析新技术
发布于2017.3.9。近期,来自上海生物化学与细胞生物学研究所的研究人员作创立了一种可以获得具有空间位置信息的少量细胞转录组图谱的技术方法:Geo-seq。这项最新研究整合了激光显微切割技术和单细胞测序技术,是一种高效、高分辨率的空间转录组分析方案,既可用于转录图谱的三维重建,也可以用于研究具有特殊结构的少量组织或细……
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lincRNA鉴定及分析新流程
发布于2017.3.3。 基因间长链非编码RNA (lincRNAs)广泛存在于真核转录组中,并具有参与转录调控、表观遗传调控等重要的生物功能。目前除了哺乳动物,其他物种的lincRNA研究较少,这类ncRNA的功能及作用机制一直吸引着很多科研人员 。 亚利桑那大学的研究人员建立了用于鉴定和研究lincR……
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机器学习和人工智能修正RNA-Seq数据的序列偏向性
发布于2017.2.28。东京大学的研究人员基于循环神经网络(Recurrent Neural Networks ,RNNs)的方法建立了修正测序序列偏向性的模型,该模型最大的优点是在RNN运算过程中能够自动识别序列的结构信息。通过修正序列偏向性,最终可修正基因表达量的计算结果。研究人员认为基于RNN的序列偏向性修正模……
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miRandb:整合后的在线miRNA检索工具
发布于2017.2.17。 近日,马什哈德大学的研究人员建立了一种简单的miRNA分类工具并搭建了miRandb数据库(miRNAalgorithmicnetworkdatabase),这个超大miRNA数据库整合了180个以上的在线miRNA检索资源。miRandb数据库中含有miRNA序列、基因组定位……
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RNA病毒进化研究重大进展
发布于2016.11.29。RNA病毒在无脊椎动物中普遍存在,多样性远超过现有病毒知识体系。RNA病毒和宿主关系复杂,既有频繁的跨物种传播,又有共同进化的特征。当今主流的生命起源假说认为,地球上的生命是在漫长时间内,由无机小分子、有机小分子、有机大分子再到有机多分子体系一步一步演变而成。但在有机多分子体系演变为……
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基因治疗
发布于2016.11.18。华中科技大学同济医院对外宣布:该院成功完成世界首例基因治疗罕见青少年双盲症。一个来自新洲区的四年前失明的小姑娘的视力恢复到0.8!神奇的基因治疗,让她重见光明。1871年,德国眼科医生Leber首先报告此病;青少年双盲病LHON,是一种遗传性视神经病变,一半为家族遗传,还有一半是基因突变发病……
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第十一届国际基因组学大会在深圳国家基因库开幕
发布于2016.11.8。2016年11月4日,由华大基因主办,深圳国家基因库和GigaScience协办的第十一届国际基因组学大会(ICG-11)开幕仪式在深圳国家基因库举行。ICG大会是一场智慧的盛宴,聚集了来自世界各地的专家、学者,共同探讨科研与学术,推动基因组学发展。以基因组学为代表的生物技术已经成为当今世界最……
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2016世界生命科学大会举行
发布于2016.11.4。2016世界生命科学大会11月1日在北京召开。10位诺贝尔奖获得者、4位世界粮食奖和沃尔夫农业奖获得者、英国皇家学会会长、美国科学院院长等众多生命科学领域专家学者应邀出席,共同探讨生物、健康、农业、环境等领域的最新研究进展及发展趋势. 本次大会以“健康、农业、环境”为主题,由中国科协主办,……
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